實務(wù)中，為了有利于公司實際控制人控制公司，有專家籌劃成立有限合伙企業(yè)作為個人的持股平臺持有上市公司股票。那么，有限合伙企業(yè)代持上市公司股票與個人直接持有上市公司股票在稅收上有什么區(qū)別?

　　一、個人轉(zhuǎn)讓上市公司股票的免增值稅，合伙企業(yè)轉(zhuǎn)讓上市公司股票需繳納增值稅。

　　根據(jù)《財政部 國家稅務(wù)總局關(guān)于全面推開營業(yè)稅改征增值稅試點的通知》(財稅〔2016〕36號)附件1銷售服務(wù)、無形資產(chǎn)、不動產(chǎn)注釋規(guī)定：金融商品轉(zhuǎn)讓，是指轉(zhuǎn)讓外匯、有價證券、非貨物期貨和其他金融商品所有權(quán)的業(yè)務(wù)活動。但《財政部 國家稅務(wù)總局關(guān)于全面推開營業(yè)稅改征增值稅試點的通知》(財稅〔2016〕36號)附件3規(guī)定：個人從事金融商品轉(zhuǎn)讓業(yè)務(wù)取得的金融商品轉(zhuǎn)讓收入免征增值稅。股票屬于有價證券，根據(jù)上述規(guī)定，個人轉(zhuǎn)讓股票免征增值稅。

　　但若自然人使用有限合伙企業(yè)持股，轉(zhuǎn)讓上市公司股票時不僅要面對可能高達35%的個稅，通常因為溢價，還需要按照“金融商品轉(zhuǎn)讓”繳納增值稅，一般計稅率為6%，并且?guī)缀鯖]有相應(yīng)的進項可以抵扣，再加上增值稅附加等稅負，溢價部分的稅負率可能超過40%。

　　二、個人從上市公司取得的股息紅利免稅，個人通過有限合伙間接持有上市公司股票的不享有免稅優(yōu)惠。

　　《關(guān)于上市公司股息紅利差別化個人所得稅政策有關(guān)問題的通知》(財稅〔2015〕101號)規(guī)定：個人從公開發(fā)行和轉(zhuǎn)讓市場取得的上市公司股票，持股期限超過1年的，股息紅利所得暫免征收個人所得稅。個人從公開發(fā)行和轉(zhuǎn)讓市場取得的上市公司股票，持股期限在1個月以內(nèi)(含1個月)的，其股息紅利所得全額計入應(yīng)納稅所得額;持股期限在1個月以上至1年(含1年)的，暫減按50%計入應(yīng)納稅所得額;上述所得統(tǒng)一適用20%的稅率計征個人所得稅。

　　三、個人從新三板取得股息紅利免稅，但個人通過有限合伙間接持有新三板股票的不享有免稅優(yōu)惠。

　　根據(jù)《關(guān)于繼續(xù)實施全國中小企業(yè)股份轉(zhuǎn)讓系統(tǒng)掛牌公司股息紅利差別化個人所得稅政策的公告》(財政部 稅務(wù)總局 證監(jiān)會公告2019年第78號)規(guī)定：個人持有掛牌公司的股票，持股期限超過1年的，對股息紅利所得暫免征收個人所得稅。個人持有掛牌公司的股票，持股期限在1個月以內(nèi)(含1個月)的，其股息紅利所得全額計入應(yīng)納稅所得額;持股期限在1個月以上至1年(含1年)的，其股息紅利所得暫減按50%計入應(yīng)納稅所得額;上述所得統(tǒng)一適用20%的稅率計征個人所得稅。

　　個人直接持有新三板的股票一年以上，可以免征個人所得稅。但是個人通過合伙企業(yè)持有新三板股票一年以上，由于適用對象僅提及個人，不包括合伙企業(yè)，因此，在財政部、國家稅務(wù)總局未更新政策口徑前，不適用于合伙企業(yè)投資者的間接投資分紅。

　　四、個人買賣境內(nèi)上市公司股票免征所得稅，個人通過有限合伙企業(yè)轉(zhuǎn)讓上市公司股票的，對個人合伙人應(yīng)按5-35%的稅率征稅，而不是按20%征稅。

　　《國家稅務(wù)總局稽查局關(guān)于2018年股權(quán)轉(zhuǎn)讓檢查工作的指導(dǎo)意見》(稅總稽便函[2018]88號)規(guī)定：......(三)關(guān)于自然人投資者從投資成立的合伙企業(yè)取得的股息、紅利是否適用財稅【2015】101號文件享受優(yōu)惠政策問題的意見答：財稅【2015】101號文件規(guī)定，個人從公開發(fā)行和轉(zhuǎn)讓市場取得上市公司股票，適用上市公司股息紅利差別化個人所得稅政策。該"個人"不包括合伙企業(yè)的自然人合伙人。

　　注：替代財稅【2015】101號的最新文件為：《財政部 稅務(wù)總局 證監(jiān)會關(guān)于繼續(xù)實施全國中小企業(yè)股份轉(zhuǎn)讓系統(tǒng)掛牌公司股息紅利差別化個人所得稅政策的公告》(財政部 稅務(wù)總局 證監(jiān)會公告2019年第78號)。合伙企業(yè)轉(zhuǎn)讓股權(quán)(股票)本來就是經(jīng)營所得，對個人合伙人應(yīng)按5-35%的稅率征稅，而不是按20%征稅。

　　五、目標(biāo)公司轉(zhuǎn)增資本時，自然人直接持股可以享受個稅遞延納稅優(yōu)惠，而個人通過有限合伙間接持股時，無法取得稅務(wù)局備案，不能享受稅收優(yōu)惠。

　　《財政部 國稅局將國家自主創(chuàng)新示范區(qū)有關(guān)稅收試點政策推廣到全國的公告》(財稅[2015]116號)，自2016年1月1日起，全國范圍內(nèi)的中小高新技術(shù)企業(yè)以未分配利潤、盈余公積、資本公積向個人股東轉(zhuǎn)增股本時，個人股東一次繳納個人所得稅確有困難的，可根據(jù)實際情況自行制定分期繳稅計劃，在不超過5個公歷年度內(nèi)(含)分期繳納，并將有關(guān)資料報主管稅務(wù)機關(guān)備案。

　　目標(biāo)公司將資本公積轉(zhuǎn)增合伙企業(yè)股東的資本(股本)，合伙企業(yè)不享有任何稅收優(yōu)惠政策，合伙企業(yè)的合伙人應(yīng)當(dāng)根據(jù)分配比例分別申報繳納企業(yè)所得稅或個人所得稅。

　　六、非上市公司授予本公司員工的股權(quán)激勵，員工可以享受遞延納稅優(yōu)惠，個人通過有限合伙作為持股平臺，不享有股權(quán)激勵的政策。

　　根據(jù)《財政部 國家稅務(wù)總局關(guān)于完善股權(quán)激勵和技術(shù)入股有關(guān)所得稅政策的通知》(財稅〔2016〕101號)規(guī)定：對符合條件的非上市公司股票期權(quán)、股權(quán)期權(quán)、限制性股票和股權(quán)獎勵實行遞延納稅政策：(一)非上市公司授予本公司員工的股票期權(quán)、股權(quán)期權(quán)、限制性股票和股權(quán)獎勵，符合規(guī)定條件的，經(jīng)向主管稅務(wù)機關(guān)備案，可實行遞延納稅政策，即員工在取得股權(quán)激勵時可暫不納稅，遞延至轉(zhuǎn)讓該股權(quán)時納稅;股權(quán)轉(zhuǎn)讓時，按照股權(quán)轉(zhuǎn)讓收入減除股權(quán)取得成本以及合理稅費后的差額，適用“財產(chǎn)轉(zhuǎn)讓所得”項目，按照20%的稅率計算繳納個人所得稅。股權(quán)轉(zhuǎn)讓時，股票(權(quán))期權(quán)取得成本按行權(quán)價確定，限制性股票取得成本按實際出資額確定，股權(quán)獎勵取得成本為零。

　　綜上，有限合伙企業(yè)作為個人代持股平臺雖然有利于公司實際控制人控制公司，但從稅收角度來看，并不是最佳選項。并且劣勢表現(xiàn)的尤為明顯：一是本來個人轉(zhuǎn)讓上市公司和新三板股票免征增值稅及附加稅費，無形中“生”出來了;二是本來個人取得上市公司和新三板的股息紅利可以免征，但通過合伙企業(yè)就不能免了;三是本來個人轉(zhuǎn)讓上市公司和新三板股票所得可以免征個人所得稅，但通過合伙企業(yè)“洗”出了個5-35%的個人所得稅;四是個人持股本來可以申請遞延納稅也不行了。整來整去，千萬別把錢給整沒了。